По словам министра образования и науки Лийны Керсна, нам нужно больше людей, обладающих приобретенными в докторантуре знаниями и навыками, чтобы справляться со стоящими перед Эстонией проблемами и привнести в общество больше научной доказательности. «Положение наших докторантов в научной карьере станет более ясным, — сказала Керсна. — Докторантам гарантируется должность младшего научного сотрудника в университете или научно-исследовательском учреждении. Пособие докторанту заменяется заработной платой, а также расширяются социальные гарантии, такие как оплачиваемый ежегодный отпуск и возможность получения компенсации по болезни. При разработке поправок мы будем учитывать разнообразие возможностей для обучения в докторантуре и опыт докторантов».
Докторант также может заключить трудовой договор с другим работодателем в области, связанной с его докторской диссертацией, например, с частным предприятием или государственным учреждением. Такой тип докторантуры в сотрудничестве с внешними партнерами называется докторантурой по передаче знаний. В этом случае докторская диссертация пишется с учетом потребностей предприятия или учреждения, а докторант продолжает работать в партнерском учреждении. Основными целями докторантуры по передаче знаний являются подготовка ведущих специалистов с докторской степенью к работе вне академической среды и развитие сотрудничества между университетами и предприятиями.
Также сохранится возможность того, чтобы докторант не заключал трудовой договор для научной деятельности. Это предназначено для тех, кто рассматривает докторантуру в основном как личный интерес и возможности для развития. Они обучаются в докторантуре параллельно с основной работой, и их исследовательская работа не вписывается в основанную на сотрудничестве между университетом и предприятием модель докторантуры или должности младшего научного сотрудника, либо докторант не хочет заключать такой договор. В этом случае он будет иметь статус студента, выполняя учебную программу в соответствии с индивидуальным планом, но не будет иметь права на получение пособия для докторантов.